收到不能抵扣的增值税专票主要有以下几种情况来分别处理:
一、企业取得不能抵扣的专用发票，不认证，不抵扣，视作普通发票处理。
借:管理费用或库存商品等，
贷:银行存款等，
这种方法的好处是，简单便捷，但一定会形成滞留票，滞留票是指销售方已开出，并抄税报税，而购货方没进行认证抵扣的增值税专用发票。滞留票是税务机关专用发票监管的重点，存在滞留票的企业很容易引起税务机构的检查。最终，企业就滞留票产生的原因做出报告说明。
二、企业取得不能抵扣的专用发票，只认证，不抵扣。作为待抵扣进项税额进行账务处理及纳税申报。
借:原材料等，
应交税费—待抵扣进项税额，
贷:银行存款等，
待抵扣进项税额作为认证后的专用发票的暂挂科目，核算已经认证，但尚未抵扣的专用发票。在一定程度上减少了滞留票的风险。但是，既然企业已经确定对应的进项不能抵扣，通过待抵扣进项税额科目过渡，也只是暂时性的处理。于是就有下面的处理。
三、企业取得不能抵扣的专用发票，先认证，后抵扣，再转出。按照进项税额转出的流程进行处理。
收到发票时:
借:原材料等
应交税费—待抵扣进项税额，
贷:银行存款等，
2、认证并抵扣，
借:应交税费—应交增值税(进项税额)，
贷:应交税费—待抵扣进项税额，
3、进项转出，
借:原材料等，
贷:应交税费—应交增值税(进项税额转出)。
增值税滞留票怎么处理？？？
增值税滞留票就是以前因某些原因超过90天没去认证,如果是电力滞留票的话,就会涉及补税的危险,应及时与税务局交涉,同时做好,完善账务处理.
增值税滞留票怎么处理？？？
所谓“滞留票”就是销售方开具了发票，开票系统已经做抄税处理，而且已经将这部分收入申报纳税，但是却没有购货方的认证信息。
处理如下：
提税时：
借：利润分配——未分配利润
贷：应交税费——应交增值税（销项税额）
缴税时：
借：应交税费——应交增值税（已交税金）
贷：银行存款
1、购货方购入的货物属于固定资产，因此没有认证并抵扣，而是全额计入固定资产，因此没有认证信息；
2、由于没有在180天的认证期认证，造成无法认证并抵扣，只有全额计入原材料或库存商品，因此没有认证信息；
3、购货方现金支付货款，货物没有入账，体外循环，以达到偷税的目的，我想你企业可能就是这种情况，因此税务机关要求你将这部分货物补交增值税。如果确实是这种情况，税务机关只补缴了增值税未补缴企业所得税（可能是地税负责所得税吧）和罚款应该是从清处理了。
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