收到不能抵扣的增值税专票主要有以下几种情况来分别处理:
一、企业取得不能抵扣的专用发票，不认证，不抵扣，视作普通发票处理。
借:管理费用或库存商品等，
贷:银行存款等，
这种方法的好处是，简单便捷，但一定会形成滞留票，滞留票是指销售方已开出，并抄税报税，而购货方没进行认证抵扣的增值税专用发票。滞留票是税务机关专用发票监管的重点，存在滞留票的企业很容易引起税务机构的检查。最终，企业就滞留票产生的原因做出报告说明。
二、企业取得不能抵扣的专用发票，只认证，不抵扣。作为待抵扣进项税额进行账务处理及纳税申报。
借:原材料等，
应交税费—待抵扣进项税额，
贷:银行存款等，
待抵扣进项税额作为认证后的专用发票的暂挂科目，核算已经认证，但尚未抵扣的专用发票。在一定程度上减少了滞留票的风险。但是，既然企业已经确定对应的进项不能抵扣，通过待抵扣进项税额科目过渡，也只是暂时性的处理。于是就有下面的处理。
三、企业取得不能抵扣的专用发票，先认证，后抵扣，再转出。按照进项税额转出的流程进行处理。
收到发票时:
借:原材料等
应交税费—待抵扣进项税额，
贷:银行存款等，
2、认证并抵扣，
借:应交税费—应交增值税(进项税额)，
贷:应交税费—待抵扣进项税额，
3、进项转出，
借:原材料等，
贷:应交税费—应交增值税(进项税额转出)。
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